第一章總則
本辦法依嚴重特殊傳染性肺炎防治及紓困振興特別條例（以下簡稱本條例）第九條第三項規定訂定之。
本辦法用詞，定義如下：一、醫療機構：指依醫療法第十五條規定領有醫療機構開業執照之機構。
二、醫事機構：指醫療法第十條第一項所定醫事人員依其專門職業法規或藥事法第三十四條規定核准開業之機構。
三、住宿式機構：指依長期照顧服務法、老人福利法、身心障礙者權益保障法或兒童及少年福利與權益保障法設立，提供全時住宿服務之機構。
四、社會福利事業單位：指具下列資格之一者：（一）依法設立，其章程明定辦理社會福利事項之社會團體、財團法人。
（二）依身心障礙者權益保障法及其相關法規規定，接受直轄市、縣（市）政府委託辦理復康巴士之服務提供單位。
（三）依直轄市、縣（市）政府辦理長期照顧特約及費用支付作業要點規定，經直轄市、縣（市）政府特約之交通接送、營養餐飲服務提供單位。
（四）依社會工作師法第二十一條第一項規定核准開業之社會工作師事務所。
五、其他照顧服務提供單位：指第三款及前款以外具下列資格之一者：（一）依長期照顧服務法及其相關法規規定設立之居家式、社區式、未提供住宿式服務之綜合式服務類長照機構。
（二）依直轄市、縣（市）政府辦理未滿二歲兒童托育準公共化服務與費用申報及支付作業要點規定，與直轄市、縣（市）政府簽約之托育服務提供者。
（三）依身心障礙者權益保障法及其相關法規規定設立之日間服務機構、經政府委託或補助辦理家庭托顧之服務提供單位。
（四）依兒童及少年福利與權益保障法及其相關法規規定設立之早期療育機構。
（五）經政府委託或補助辦理兒童及少年團體家庭之服務提供單位。
六、藥商：指藥事法第十六條第一項規定之藥品製造業者或第十五條第一款規定之西藥販賣業者。
七、原料藥：指一種經物理、化學處理、或生物技術過程製造所得具藥理作用之活性物或成分，常用於藥品、生物藥品或生物技術產品之製造者。
八、中藥材：指源自於自然界，依中醫藥理論，載於臺灣中藥典、固有典籍或經中央衛生主管機關認定之其他各國藥典及其補充典籍，得供藥品使用之礦物或特定基原之植物與動物之原藥材、加工品及飲片，為製造中藥製劑之原料。
九、民俗調理業：指依民俗調理業管理規範規定，經營傳統整復推拿、按摩、腳底按摩及經絡調理之業者。
十、精神復健機構：指依精神衛生法及其相關法規規定核准開業之機構。
第二章停診醫療機構之補償
醫療機構因配合中央流行疫情指揮中心防疫需要，經地方衛生主管機關書面通知停診者，其在停診原因存續期間之損失，得向中央衛生主管機關申請補償。
但已依傳染病防治法或其他法規領取補償者，不得重複申請。
前項停診損失之補償基準，依下列規定辦理：一、全民健康保險（以下簡稱健保）特約醫療服務機構全面停診者：以前一年同期之健保申報醫療費用點數及掛號費給予補償，申報點數不包括藥費及特殊材料費，點數以一點新臺幣一元計算，或以停診原因存續期間所應支出之基本人事費、維持費及掛號費給予補償，擇一申請。
特約未滿一年之健保特約醫療服務機構及非健保特約醫療服務機構，以停診原因存續期間所應支出之基本人事費、維持費及掛號費給予補償。
二、健保特約醫療服務機構部分停診，整體醫療費用未及前一年同期者：以停診原因存續期間被停診部分所應支出之基本人事費、維持費及掛號費給予補償。
特約未滿一年之健保特約醫療服務機構及非健保特約醫療服務機構部分停診者，亦同。
前條第二項所定基本人事費，為於各該醫療機構停診前已任職，而於停診期間仍留任人員之經常性給與薪資，或停診之個別醫師於前一年同期之健保申報醫療費用點數，點數以一點新臺幣一元計算。
前項經常性給與薪資，不包括不定期獎勵金，並以停診前六個月之經常性薪資平均計算；未能提供薪資證明文件者，逕以其參加健保之投保金額計算。
第一項停診之個別醫師於前一年同期健保申報醫療費用點數，不包括藥費及特殊材料費。
基本人事費之補償，以醫療機構對停診前已任職之人員，於停診期間繼續給付薪資者為限。
第三條第二項所定維持費，包括各該醫療機構於停診期間應負擔之水費、電費、電話費、瓦斯費、租金、管理費、清潔費、各類社會保險之保險費及其他為維持運作所需之費用。
醫療機構申請補償，應於停診原因消滅後六個月內，向中央衛生主管機關提出。
停診期間連續滿三十日者，得自滿三十日之翌日起，先申請發給該期間之補償。
醫療機構申請補償，應填具申請書，並檢附下列文件、資料：一、領據。
二、人員薪資證明。
三、各項維持費之證明。
四、其他中央衛生主管機關指定之證明文件、資料。
第三章營運困難醫療（事）機構之紓困
本條例第九條第一項所定受嚴重特殊傳染性肺炎影響而發生營運困難之醫療（事）機構，指有下列情形之一者：一、受地方衛生主管機關書面通知停業而業務中斷。
二、自中華民國一百零九年一月十五日起，連續六個月醫務收入或執行業務所得總額，較前一年同期醫務收入或執行業務所得總額減少百分之十五以上。
三、自中華民國一百零九年一月十五日起，連續三個月醫務收入或執行業務所得總額，較前一年同期醫務收入或執行業務所得總額減少百分之三十以上。
四、其他特殊狀況，經中央衛生主管機關或其委任、委託之機關（構）專案認定。
中央衛生主管機關對前條醫療（事）機構提供之紓困措施如下：一、補貼停業原因存續期間之損失。
二、提供信用保證，協助醫療（事）機構取得支付員工薪資之貸款（以下簡稱員工薪資貸款）。
三、補貼短期週轉金貸款及員工薪資貸款之利息。
前項第三款之利息補貼，與其他政府機關所定補貼性質相同者，醫療（事）機構應擇一適用，不得重複。
醫事機構因配合中央流行疫情指揮中心防疫需要，或其醫事人員因照顧對象確診，致該醫事人員被隔離無法執行業務，經地方衛生主管機關書面通知停業者，其在停業原因存續期間之損失，得向中央衛生主管機關申請補貼。
但已依傳染病防治法或其他法規領取補貼者，不得重複申請。
前項停業損失之補貼基準、基本人事費與維持費之認定、申請期間、申請程序及應檢附之文件、資料，準用第三條第二項及第四條至第七條規定辦理。
有下列情事之一者，不得申請員工薪資貸款：一、醫療（事）機構或其負責人使用票據經拒絕往來，尚未恢復或恢復使用後仍有存款不足遭退票。
二、醫療（事）機構或其負責人向金融機構借款逾期未償還。
員工薪資貸款，由財團法人中小企業信用保證基金（以下簡稱信保基金）提供十成保證，其保證期間之手續費，由中央衛生主管機關全額負擔。
員工薪資貸款之利率，最高按中華郵政股份有限公司二年期定期儲金機動利率加百分之一計算。
員工薪資貸款期限由金融機構與醫療（事）機構自行商定，並得由承貸金融機構視實際需要予以展延。
醫療（事）機構於員工薪資貸款期間，不得減薪或裁員。
員工薪資貸款額度，按中華民國一百零九年二月投保勞工保險之人員及其投保薪資總額核給之；最高以核給三個月薪資總數為限，且每一醫療（事）機構貸款，累計不得超過新臺幣二千萬元。
醫療（事）機構申請員工薪資貸款之期限，至中華民國一百零九年十二月三十一日止；必要時，得展延至一百十年六月三十日。
員工薪資貸款，自首次動撥日起一年內得寬限付息不還本。
醫療（事）機構申請員工薪資貸款，應檢附金融機構規定之相關憑證及證明文件，向各承辦金融機構辦理。
中央衛生主管機關得就醫療（事）機構辦理之下列事項，提供利息補貼：一、短期週轉金貸款。
二、第九條第一項第二款之員工薪資貸款。
前項第一款之貸款額度，最高以新臺幣五百萬元為限。
醫療（事）機構申請前條第一項第一款貸款者，按實際貸款餘額，補貼其利息，補貼利率最高按中華郵政股份有限公司二年期定期儲金機動利率加百分之一計算；申請前條第一項第二款貸款者，其利息全額補貼。
前項補貼期間，最長為一年。
醫療（事）機構申請第十七條第一項第一款貸款，其未能提供抵押品、擔保品或提供不足者，由承辦金融機構依保證規定移送信保基金辦理信用保證。
申貸之醫療（事）機構不得違反第九條第二項、第十二條第四項規定，或未經承貸金融機構同意變更貸款用途。
違反者，承貸金融機構應即收回貸款或補貼之利息。
中央衛生主管機關督導及執行授信措施，或承貸金融機構與信保基金辦理本辦法相關貸款及信用保證，各經辦人員對非由於故意、重大過失或舞弊情事所造成之呆帳，民營金融機構及信保基金之各級承辦人員得免除相關行政及財務責任；中央衛生主管機關及公營金融機構之各級承辦人員得依審計法第七十七條第一款規定免除全部之損害賠償責任，或免除予以糾正之處置。
第四章營運困難住宿式機構之紓困
住宿式機構有下列情形之一者，為本條例第九條第一項所定受嚴重特殊傳染性肺炎影響而發生營運困難之事業：一、受地方主管機關書面通知停業而業務中斷。
二、自中華民國一百零九年一月十五日起，任連續三個月平均收入，較一百零八年下半年或一百零八年同期月平均收入減少達百分之十五。
三、其他特殊狀況，經中央衛生主管機關或其委任、委託之機關（構）或團體專案認定。
中央衛生主管機關對前條住宿式機構提供之紓困措施如下：一、補貼停業原因存續期間之損失。
二、提供信用保證，協助住宿式機構取得支付員工薪資之貸款。
三、補貼住宿式機構之短期週轉金貸款及員工薪資貸款之利息。
前項第三款之利息補貼，與其他政府機關所定補貼性質相同者，住宿式機構應擇一適用，不得重複。
提供住宿式機構第一項第二款及第三款之紓困措施，其貸款之資格限制、信用保證、利率、期限、額度、上限及其他相關事項，準用第十一條至第二十二條規定。
住宿式機構因配合中央流行疫情指揮中心防疫需要，或其人員因照顧對象確診，致該機構人員被隔離無法執行業務，經地方主管機關書面通知停業者，其在停業原因存續期間之損失，得向中央衛生主管機關申請補貼。
但已依傳染病防治法或其他法規領取補貼或補助者，不得重複申請。
前項停業損失之補貼基準，按停業原因存續期間所應支出之基本人事費及維持費給予。
前項基本人事費，為於各該住宿式機構停業前已任職，而於停業期間仍留任人員之經常性給與薪資，並按停業前六個月之經常性薪資平均計算；未能提供薪資證明者，逕以其參加健保之投保金額計算。
基本人事費之補貼，以住宿式機構對停業前已任職之人員，於停業期間繼續給付薪資者為限。
住宿式機構停業損失補貼之維持費認定、申請期間、申請程序及應檢附之文件、資料，準用第五條至第七條規定辦理。
第四章之一營運困難社會福利事業單位及其他照顧服務提供單位之紓困
社會福利事業單位有下列情形之一者，為本條例第九條第一項所定受嚴重特殊傳染性肺炎影響而發生營運困難之事業：一、最近五年內曾接受政府委託辦理社會福利業務且無違約情形，自中華民國一百零九年一月十五日起，任連續三個月之捐贈、接受政府補助、委託辦理或銷售貨物、勞務收入總和之月平均，較一百零八年下半年或一百零八年同期月平均減少達百分之十五。
二、其他特殊狀況，經中央衛生主管機關或其委任、委託之機關（構）或團體專案認定。
中央衛生主管機關對前條社會福利事業單位提供之紓困措施如下：一、提供信用保證，協助社會福利事業單位取得支付員工薪資之貸款。
二、補貼社會福利事業單位之短期週轉金貸款及員工薪資貸款之利息。
三、補助服務存續期間所應支出之維持費，及因服務量增加之人員超時工作酬勞，每月最高補助金額為前條第一款收入總和月平均較一百零八年下半年或一百零八年同期月平均短差之百分之四十，最長三個月。
前項第三款費用之認定及應檢附之文件、資料，準用第五條及第七條規定辦理。
第一項第二款之利息補貼及第三款之費用補助，與其他政府機關所定補貼（助）性質相同者，社會福利事業單位應擇一適用，不得重複。
提供社會福利事業單位第一項第一款及第二款之紓困措施，其貸款之資格限制、信用保證、利率、額度、上限及其他相關事項，準用第十一條至第十三條、第十五條至第二十二條規定。
其他照顧服務提供單位有下列情形之一者，為本條例第九條第一項所定受嚴重特殊傳染性肺炎影響而發生營運困難之事業：一、受地方主管機關書面通知停業而業務中斷。
二、自中華民國一百零九年一月十五日起，任連續三個月於長期照顧給付及支付、未滿二歲兒童托育準公共化服務申報費用月平均，較一百零八年下半年或一百零八年同期月平均減少達百分之十五。
但接受政府補助或委託辦理第二條第五款第三目至第五目之服務，為任連續三個月辦理第二條第五款第三目至第五目之服務月平均補助或委辦費用，較一百零八年下半年或一百零八年同期月平均減少達百分之十五。
三、其他特殊狀況，經中央衛生主管機關或其委任、委託之機關（構）或團體專案認定。
中央衛生主管機關對前條其他照顧服務提供單位提供之紓困措施如下：一、補貼停業原因存續期間之損失。
二、提供信用保證，協助其他照顧服務提供單位取得支付員工薪資之貸款。
三、補貼其他照顧服務提供單位之短期週轉金貸款及員工薪資貸款之利息。
前項第一款之損失補貼及第三款之利息補貼，與其他政府機關所定補貼（助）性質相同者，其他照顧服務提供單位應擇一適用，不得重複。
第一項第一款停業損失補貼之事由、基準、認定、申請程序及應檢附之文件、資料，準用第五條、第七條及第二十五條第一項至第四項規定辦理。
提供其他照顧服務提供單位第一項第二款及第三款之紓困措施，其貸款之資格限制、信用保證、利率、額度、上限及其他相關事項，準用第十一條至第十三條、第十五條至第二十二條規定。
社會福利事業單位及其他照顧服務提供單位申請第二十五條之二第一項第三款或第二十五條之四第一項第一款之紓困措施，應於中央衛生主管機關公告之受理期間內，檢附申請書及相關證明文件、資料，向中央衛生主管機關或其委任、委託之機關（構）或團體提出。
前項申請案件不符合規定得補正者，經通知限期補正，屆期未補正，不予受理。
第五章營運困難藥商之紓困
藥商有下列情形之一者，為本條例第九條第一項所定受嚴重特殊傳染性肺炎影響而發生營運困難之事業：一、製造藥品所需之原料藥或中藥材有不足供應情形，致該原料藥、其他來源替代原料藥或中藥材之平均單位成本超過該原料藥或中藥材前三年平均單位成本之一點五倍，或製劑輸入成本超過該製劑前三年平均單位成本之一點五倍。
二、未能足量取得製造製劑所需之原、物料或可替代之原、物料，或為配合中央流行疫情指揮中心所為應變處置，致國內之製劑產線減產或停產，難以維持藥商該製劑前三年平均生產量之百分之八十。
前條藥商，得由中央衛生主管機關補貼其成本差額或生產成本。
前項成本差額或生產成本之補貼，單一原料藥或製劑品項，以新臺幣二十萬元為上限，且單一藥商補貼總金額不得超過新臺幣二百萬元。
藥商申請前條之補貼，應檢附相關憑證及證明文件、資料，向中央衛生主管機關提出。
前項申請，至遲應於本條例施行期間屆滿之日提出。
中央衛生主管機關受理前條之申請，應依藥商營運困難情形及其檢附之證明文件、資料進行審議。
前項審議，中央衛生主管機關得邀集中央經濟主管機關、中央財政主管機關或學者專家為之。
第五章之一營運困難民俗調理業之紓困
民俗調理業有下列情形者，為本條例第九條第一項所定受嚴重特殊傳染性肺炎影響而發生營運困難之事業：一、依法辦理公司登記、商業登記、有限合夥登記、無上述登記而有稅籍登記之營利事業，或依商業登記法第五條得免辦理登記之小規模商業。
二、自中華民國一百零九年一月起，任連續二個月平均營業額，較一百零八年下半年或一百零八年同期平均營業額減少達百分之十五。
民俗調理業者有前項以外特殊狀況，經中央衛生主管機關或其委任、委託之機關（構）、團體專案認定者，亦屬本條例第九條第一項所定受嚴重特殊傳染性肺炎影響而發生營運困難之事業。
中央衛生主管機關對符合前條規定之民俗調理業者，每業者補貼新臺幣一萬元，最高以新臺幣三萬元為限。
營運困難民俗調理業者申請前條之補貼，應於中央衛生主管機關公告之受理期間內，檢附申請書及相關證明文件，向中央衛生主管機關或其委任、委託之機關（構）或團體提出。
前項申請案件不符合規定得補正者，經通知限期補正，屆期未補正，不予受理。
前條補貼之受理申請，經中央衛生主管機關委任、委託相關機關（構）或團體辦理者，該機關（構）或團體於完成申請案件審查後，應將審查結果送中央衛生主管機關備查。
第六章附則
精神復健機構之紓困條件、紓困措施之種類及相關執行事項，準用第三章規定辦理。
本辦法所定補償、紓困事項，中央衛生主管機關得委任、委託相關機關（構）或團體辦理。