本辦法依海洋污染防治法(以下簡稱本法)第十八條第三項規定訂定之。
公私場所從事海域工程不得排放油、廢(污)水於海洋。
但其排放油、廢(污)水符合海洋放流水標準且無降低海域環境分類之虞，經向中央主管機關申請取得排放許可文件者，不在此限；其經許可者，應依許可內容排放。
依前條規定申請油、廢(污)水排放許可應繳納審查費，並檢具下列文件：一、申請書。
二、公私場所經政府機關核准登記證明文件。
三、公私場所負責人身分證明文件、住址及聯絡電話。
四、海域工程經政府機關核准進行之相關證明文件。
五、海域工程負責人身分證明文件、住址及聯絡電話。
六、符合本法施行細則第十四條規定之海洋污染防治計畫書。
七、其他經中央主管機關指定之文件。
中央主管機關受理油、廢(污)水排放申請，應於兩個月內完成審查。
必要時得延長兩個月，但以一次為限。
前項申請文件經審查不合本辦法之規定或內容有欠缺者，應通知限期補正，補正日數不算入前項審查期限內；屆期未補正者應予駁回。
第一項審查必要時得會商相關目的事業主管機關為之。
排放許可文件應記載內容如下：一、基本資料：(一)公私場所名稱及地址。
(二)公私場所負責人姓名、身分證件字號及住址。
(三)海域工程名稱及衛星定位(GPS)座標。
(四)海域工程負責人姓名、身分證件字號及住址。
二、排放許可內容：(一)海洋污染防治設備名稱、處理容量及處理效率。
(二)排放設施及排放口位置。
(三)排放污染物種類、最大許可濃度及排放量上限。
(四)其他經中央主管機關規定之事項。
三、排放許可文件有效期限及許可字號。
前條排放許可文件所記載之基本資料有變更者，應於事實發生之日起三十日內向中央主管機關辦理變更登記；其變更涉及排放許可內容者，應重新申請排放許可。
排放許可文件於有效期間內毀損或滅失者，應於事實發生後三十日內以書面敘明原因，並檢附第三條第二款至第四款之文件向中央主管機關申請補發。
取得排放許可之海域工程排放油、廢(污)水設施廢止或停用者，公私場所應自廢止或停用之日起三十日內報請中央主管機關備查。
公私場所海域工程排放油、廢(污)水有下列情形之一者，中央主管機關應撤銷或廢止其許可：一、申請許可文件虛偽不實者。
二、六個月內違反第五條第二款第二目至第四目之一兩次者。
三、變更廢(污)水排放許可內容未依第六條規定重新申請者。
四、未依第八條規定辦理者。
公私場所經中央主管機關通知審查核可後，應繳納證明書費始得領取排放許可文件。
違反第二條、第五條第二款、第六條或第八條者，依本法第四十七條規定處罰之。
本辦法施行前已進行之海域工程有排放油、廢(污)水之行為者，應自本辦法施行之日起一年內取得許可文件始得排放。