為彙集社會資源保育海洋野生動物，依野生動物保育法（以下簡稱本法）第七條第二項規定，設立海洋野生動物保育捐助專戶（以下簡稱本專戶），並訂定本辦法。
本辦法之主管機關為海洋委員會（以下簡稱本會），執行機關為本會海洋保育署。
本專戶捐款之收支管理、稽核等事項，依公益勸募條例及會計相關法規辦理。
本專戶接受個人、法人或其他設有代表人或管理人之非法人團體捐贈，並應開立捐贈收據。
前項捐贈者為自然人，捐贈收據應載明捐贈人姓名、國民身分證統一編號、捐贈金額、指定之用途等事項；捐贈者為法人或其他設有代表人或管理人之非法人團體，捐贈收據應載明法人或非法人團體之名稱、營利事業統一編號或財稅機關編發之統一編號、捐贈金額、指定之用途等事項。
本專戶款項之來源如下：一、個人、法人或非法人團體捐贈之民間捐款。
二、本專戶孳息收入。
三、其他收入。
本專戶之用途如下：一、海洋野生動物資源之調查、研究及經營管理。
二、海洋野生動物棲息環境之用地取得、保護及改善。
三、依本法第十二條第四項規定之損失補償。
四、依本法第十四條第一項及第十五條規定所為必要之處置及處理。
五、民間團體及個人參與推動海洋野生動物保育工作之協助或獎勵。
六、依本法第三十一條第四項規定對於海洋野生動物之收購。
七、海洋野生動物保育之教育及宣導。
八、海洋野生動物保育人員之教育及訓練。
九、海洋野生動物保育之國際技術合作。
十、其他有關海洋野生動物保育事項。
十一、本專戶業務所需行政費用。
為管理及運用本專戶，主管機關應組成海洋野生動物保育捐助專戶管理委員會（以下簡稱管委會），審議下列事項：一、本專戶之年度運用計畫及計畫執行報告。
二、本專戶之管理及動支事項。
三、本專戶之預算、決算及會計報告。
四、其他經主任委員提請審議之事項。
管委會置委員七人至十一人，由本會就下列人員聘任之，其中一人為主任委員，由委員互選之：一、行政機關代表三人。
二、專家學者三人至五人。
三、熱心海洋保育事務人士一人至三人。
管委會委員聘期二年，期滿得續聘。
但行政機關代表，應隨其本職進退。
委員因故出缺時，得補聘之。
補聘委員之任期至原委員任期屆滿之日止。
管委會委員均為無給職。
第一項委員之任一性別比例不得少於三分之一。
管委會每年開會一次，必要時得召開臨時會議，並得邀請有關機關派員列席。
前項會議由主任委員召集並為主席，主任委員因故不能出席時，由主任委員指派委員一人為主席。
會議之決議，應經過半數委員出席及出席委員過半數之同意；可否同數時，取決於主席。