情報機關調查發現有違常人員涉嫌間諜行為之相關證據時，應評估案情對國家安全或利益之影響程度，依下列方式處理之：
一、無立即明顯之影響者，應即將案件函請司（軍）法機關偵辦，並報請主管機關核備。
二、具有國家機密保護法施行細則第五條至第七條各款所列之情形者，得評估案情，由情報機關自行決定是否依第十二條之規定，對涉嫌者實施反爭取運用，並應適時進行損害控管。