中央主管機關應就全國性海域水體，依其海域環境分類設置海域環境水質監測站；直轄市、縣（市）主管機關應就其轄區內之海域水體，依其海域環境分類設置海域環境水質監測站。
主管機關應於每年四月十五日前，公布前一年之海域環境水質監測資料。