第9條辦理補貼審查之任務如下：一、申請路(航)線別補貼計畫之審查。二、申請路(航)線別每車公里、每航次浬合理營運成本之審查。三、資本設備投資合理成本之審查。四、申請路(航)線別補貼優先順序、分配比率、監督考核事項之審查。五、原核定路(航)線別補貼計畫修訂之審查。六、補貼與營運評鑑結果運用方式之審查。七、合理營運成本及合理資本設備投資成本權重值之審查。八、其他與補貼相關事宜之審查。