個人生物特徵識別資料錄存方式如下：一、指紋：應以左、右手食指接受按捺。
左、右手食指有殘缺或傷病者，依拇指、中指、環指、小指之順序接受按捺，並由錄存人員註明手指名稱。
但無手指，且經錄存人員註明者，不在此限。
二、臉部：應以臉部正面脫帽平視接受臉部影像擷取，有影響影像擷取之物品，應予去除。
個人生物特徵識別資料錄存應力求清晰，不清晰者，應重新辦理錄存。
已接受個人生物特徵識別資料錄存者，因殘缺、傷病或其他原因，致無法與原錄存之識別資料辨識相符者，應於再次入出國（境）查驗時，依第一項方式重新接受錄存。
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