為加速離島建設，特依離島建設條例第十六條第一項規定，設置離島建設基金(以下簡稱本基金)，並依同條第二項及預算法第二十一條規定，訂定本辦法。
本基金為預算法第四條第一項第二款所定之特種基金，編製附屬單位預算，以行政院為主管機關。
本基金之來源如下：一、中央政府分十年編列預算或指定財源撥入。
二、縣（市）主管機關編列預算撥入。
三、基金孳息。
四、人民或團體之捐助。
五、觀光博弈業特許費。
六、其他收入。
本基金之用途如下：一、離島開發建設計畫之補助、貸款及投資項目。
二、為辦理離島建設之需要，需修訂縣(市)綜合發展計畫，或訂定離島綜合建設實施方案所需經費之補助。
三、離島建設指導委員會所需之經費。
四、管理及總務支出。
五、其他有關支出。
前項第一款用途，應以納入離島綜合建設實施方案之項目為優先。
本基金之保管及運用應注重收益性及安全性，其存儲並應依公庫法及其相關法令規定辦理。
本基金為應業務需要，得購買政府公債、國庫券或其他短期票券。
本基金之收支、保管及運用，應設置離島建設基金管理會（以下簡稱本會），置委員十一人至十五人，其中一人為召集人，由國家發展委員會主任委員擔任，一人為副召集人，由行政院主計總處副主計長擔任；副召集人及其餘委員，由國家發展委員會就相關機關代表及有關人員聘兼之。
本會置執行秘書一人，組長三人至五人，組員若干人，均就現職人員派兼之。
本會原則每三個月至六個月開會一次，必要時得召開臨時會議，均由召集人召集之；召集人因故不能出席時，由副召集人代理之；副召集人亦不能出席時，由出席委員互推一人代理之。
本會之任務如下：一、本基金收支、保管及運用之審議。
二、本基金年度預算及決算之審議。
三、本基金運用執行情形之考核。
四、其他有關事項。
本基金有關預算編製與執行及決算編造，應依預算法、會計法、決算法、審計法及相關法令規定辦理。