本辦法依國營港務股份有限公司設置條例（以下簡稱本條例）第十四條第一項規定訂定之。
本辦法之適用對象，以原交通部各港務局及所屬機構（以下簡稱原機構）依交通事業人員任用條例或公務人員任用法律任用之人員，於臺灣港務股份有限公司（以下簡稱港務公司）成立之日隨同業務轉調港務公司繼續任用，仍具公務人員身分者（以下簡稱繼續任用人員）為範圍。
繼續任用人員轉調港務公司之職務，應與轉調前所任原機構之職務等級相當。
港務公司應依原機構改制前之職稱及轉調後等級相當之職稱，訂定職務對照表，經港務公司董事會通過後，並報交通部備查；修正時，亦同。
港務公司應訂定以交通事業人員任用條例繼續任用人員之資位職務薪給表、轉調人員之職責層次表，經港務公司董事會通過後施行；修正時，亦同。
港務公司應就繼續任用人員轉調後之職稱，依職務高低、性質及業務需要，訂定陞遷考核作業要點及陞遷序列表。
繼續任用之交通事業人員，其任用審查及考成審定由港務公司審定。
繼續任用人員應由政府繳付之公教人員保險及全民健康保險之保險費、公務人員退休撫卹基金費用，由港務公司編列預算支應，並依公教人員保險法、全民健康保險法、公務人員退休法、公務人員撫卹法及其相關規定辦理撥繳事宜。
繼續任用人員依公務人員相關法令辦理退休、撫卹或資遣者，其具有退撫新制施行前應發給之退休金、撫慰金、撫卹金、資遣給與、補償金、殮葬補助費，由港務公司編列預算支應。
繼續任用人員退休或在職亡故者之照護，由港務公司參照行政院所定退休人員照護事項或公務人員遺族照護辦法辦理。
繼續任用人員因公涉訟之輔助，及因公傷亡慰問金之發給，由港務公司編列預算支應。