國立臺灣大學為醫學教育研究及醫療服務之需要，特設置附設醫院作業基金(以下簡稱本基金)，並依預算法第二十一條規定訂定本辦法。
本基金為預算法第四條第一項第二款所定之特種基金，編製附屬單位預算，下設各分院作業基金，編製附屬單位預算之分預算。
本基金以教育部為主管機關，國立臺灣大學醫學院附設醫院為管理機關；所屬各分院作業基金以各分院為管理機關。
本基金之來源如下：一、政府循預算程序之撥款。
二、醫療收入。
三、教學訓練及建教合作收入。
四、其他有關收入。
本基金之用途如下：一、醫療成本支出。
二、教學訓練、研究發展及建教合作支出。
三、管理及總務支出。
四、其他有關支出。
本基金之保管及運用應注重收益性及安全性，其存儲並應依公庫法及其相關法令規定辦理。
本基金為應業務需要，得購買政府公債、國庫券及其他短期票券。
本基金有關預算編製與執行及決算編造，應依預算法、會計法、決算法、審計法及相關法令規定辦理。