殘留管制組掌理事項如下：
一、農產品與其加工品中農業藥物毒物之殘留檢測及技術研發。
二、農業環境中農業藥物毒物之殘留檢測及管制策略研究。
三、農產品中農業藥物毒物殘留標準之研訂及管制策略之研究。
四、農藥品質規格之檢驗及技術研發。
五、區域檢驗中心檢測之運作及技術輔導。
六、其他有關殘留管制研究事項。