應用毒理組掌理事項如下：
一、農業藥物毒物對人畜健康危害之評估及研究。
二、農業藥物毒物對環境成員安全危害之評估及研究。
三、農業藥物毒物之風險評估研究及風險管理策略之研析。
四、安全評估與毒理試驗技術及品質規範之研究。
五、其他有關應用毒理研究事項。