農業工程組掌理事項如下：
一、農業機械、技術及作業體系之開發及研究。
二、農業栽培環境監控、設施與管理機具自動化控制及電子化資訊系統之應用研究。
三、農業機械操作效能、安全防護技術之研究、性能測定及技術諮詢服務。
四、農業氣象服務、災害應變防範及氣候變遷下農產業調適之研究。
五、其他有關農業工程研究事項。