本會掌理事項如下：
一、聯合審計發展及推動策略之研議。
二、國際聯合審計發展趨勢之研析。
三、聯合審計案件之規劃與查核（含審核通知之繕發及後續追蹤）。
四、各審計單位聯合審計案件之支援或協調。
五、審計長交辦事項。