本會置執行秘書一人，承主任委員之命，處理本會會務；置副執行秘書一人，輔助執行秘書處理會務；置若干審計官（參事）督導、協調與指揮聯合審計案件辦理；置若干簡任審計（稽察）協助推動聯合審計事務。
並分組辦事，各置組長一人，工作人員若干人，辦理所任事務。
前項人員均由本部法定員額內派充。