校長對主管機關有關其個人之措施，認為違法或不當，致損害其權益者，依法得依下列途徑救濟：
一、準用教師申訴相關規定，提起申訴、再申訴、行政訴訟。
二、提起訴願、行政訴訟。
校長申訴之程序分直轄市、縣（市）及中央二級。
校長對於直轄市、縣（市）主管機關之措施不服者，得向直轄市、縣（市）主管機關教師申訴評議委員會提起申訴；不服申訴決定者，得向中央教師申訴評議委員會提起再申訴。
國立學校校長對於主管機關之措施不服者，得向中央教師申訴評議委員會提起申訴，並以再申訴論。