中央主管機關得委託財團法人臺灣兩岸漁業合作發展基金會（以下簡稱兩岸漁合會）辦理下列事項：
一、海峽兩岸漁船船員勞務合作協議之執行性或事務性事項。
二、前條第三項所定申訴案件之協調。
三、第十二條第一項所定收取保證金、第十九條第一項所定通知仲介機構限期清償或給付或以保證金清償或給付、第二十一條第六項及第七項所定退還保證金等事項。
四、第十七條第三項所定契約備查。
五、第二十條所定仲介機構之評鑑。