會計室職掌如下：
一、年度預算及分配預算之籌劃編擬事項。
二、預算執行及財務之審核、監督事項。
三、年度決算之編擬事項。
四、經費流用、追加減預算及保留款項之陳報事項。
五、編製作業基金運用績效報告，並檢討分析、標明成本效益比較及改進建議事項。
六、現金、票據、證券、財產物品之增減、保管、移轉之查校及有關財物契約之審核簽證事項。
七、會計報告之編製暨收支憑證之保管、備查事項。
八、財物購置、變賣、營繕工程之會監、會驗事項。
九、業務上應用統計之蒐集、登記、整理、分析編報事項。
十、本室會計人員之任免、遷調、考核、獎懲之擬辦事項。
十一、增進財務上效能及減少不經濟支出之建議事項。
十二、其他交辦事項。