為支應放射性廢棄物處理、運送、貯存、最終處置、除役及必要之回饋措施等所需後端處理與處置費經費，確保核能後端營運工作執行，特設置核能發電後端營運基金（以下簡稱本基金），並依預算法第二十一條規定，訂定本辦法。
本基金為預算法第四條第一項第二款所定之特種基金，編製附屬單位預算，以經濟部（以下簡稱本部）為主管機關。
本基金之來源如下：一、發電業設有核能發電廠者，於其核能發電廠營運期間繳交之核能發電後端營運費用。
二、由政府循預算程序之撥款。
三、本基金之孳息收入。
四、其他有關收入。
本基金之用途如下：一、核能發電有關之核子設施運轉維護所產生低放射性廢棄物之獨立減容、處理、包裝、運輸、中期貯存及最終處置。
二、用過核子燃料再處理。
三、用過核子燃料或其再處理所產生放射性廢棄物之包裝、運輸、中期貯存及最終處置。
四、核能發電有關核子設施之除役拆廠及其所產生廢棄物之處理、包裝、運輸、中期貯存及最終處置。
五、必要之回饋措施。
六、管理及總務支出。
七、其他有關支出。
本基金之收支、保管及運用，應設核能發電後端營運基金管理會（以下簡稱本會），置委員十三人至十七人，其中一人為召集人，由本部部長派員兼任之；其餘委員，由本部就有關機關（構）、團體代表、學者、專家派（聘）兼之，任期二年，期滿得續聘，均為無給職。
前項學者、專家及團體代表，不得少於委員總人數二分之一。
本會每三個月開會一次，必要時得召開臨時會議，均由召集人召集之；召集人因故不能出席者，由召集人指定委員一人代理。
本會會議之召開，於必要時得邀請後端營運業務執行機關（構）及專家、學者列席說明。
本會之任務如下：一、本基金收支、保管及運用之審議。
二、本基金年度預算、決算之審議。
三、本基金運用執行情形之考核。
四、其他有關事項。
本會置執行秘書一人，由本部派員專任或就本部現職人員派兼之；置組長三人，組員三十人至四十人，分組辦事，就本部或後端營運業務執行機關（構）派員專任或就現職人員派兼之，並得視業務需要聘僱人員；其員額循預算程序定之。
核能發電後端營運工作，由後端營運業務執行機關（構）依法令規定或工作性質之需研提計畫，報請本部核定後負責執行。
本基金有關預算編製及執行、決算編造，應依預算法、會計法、決算法、審計法及相關法令規定辦理。
本基金之保管及運用應注重收益性及安全性，其存儲並應依公庫法及其相關法令規定辦理。
本基金為應業務需要，得購買政府公債、國庫券、金融債券或其他短期票券。
前項金融債券及其他短期票券之發行公司，應經金融主管機關核准經營信用評等事業之機構評定為一定等級以上。
前項規定之一定等級，由本部定之。
本基金尚未動用餘額，得貸予設有核能發電廠之發電業支應核子燃料營運或電源開發之用；其個案貸款額度及累積貸款額度應按季彙報本部備查。