中央主管機關得向工業專用港或工業專用碼頭之使用人，依其使用工業專用港或工業專用碼頭之進出口貨物噸數計收管理費。
前項所稱工業專用港或工業專用碼頭之使用人，指該貨物所有人。
工業專用港或工業專用碼頭之相關設施所有權人，得向設施使用人，依其使用工業專用港或工業專用碼頭之進出口貨物噸數計收使用費。
工業專用港或工業專用碼頭之建築物所有權人，得向建築物使用人，依其使用建築物坪數計收使用費。
工業專用港或工業專用碼頭之經營管理者，得向工業專用港或工業專用碼頭之使用人，依其使用工業專用港或工業專用碼頭之服務性質、船舶總噸位、時間或營運成本計收服務費。
前項服務費之項目，包括港勤、碇泊、移泊、加油、加水、廢棄物處理及其他中央主管機關會商交通部核定之項目。
前三條之費用收取人應提報收費項目、費率及計算方式，交由中央主管機關會商交通部定之；調整時，亦同。
各港之管理費、使用費與服務費之收費項目、費率及計算方法，分別列如附表一、附表二及附表三。