申請案件以不影響公共通行及公共水域使用為原則，並應依下列規定辦理：
一、有影響船舶航行安全之虞者，應取得航政、國防、海巡及漁業主管機關同意文件或書面意見。
二、為確保航行安全，施工及營運階段，應設置安全警示裝置，並依航政主管機關之通報規定辦理。