本院設下列各處室：
一、監察業務處，分五組及陳情受理中心辦事。
二、監察調查處，分八組辦事。
三、公職人員財產申報處，分六組辦事。
四、秘書處，分五科辦事。
五、綜合業務處，分四科辦事。
六、會計室。
七、統計室。
八、人事室。
九、政風室。