依本法第十四條規定，運安會得優先保管有關證物。
於調查期間，得將已無調查需要之有關證物返還相關機關（構）。
運安會於調查報告發布後，應儘速將船舶、殘骸、文件及手冊等相關證物返還有關機關（構）。
重大水路事故如涉及人員傷亡，須獲檢察機關同意後，始得將相關證物返還有關機關（構）。