第12條人事室掌理事項如下：一、關於組織編制之擬辦事項。二、關於人事規章之擬訂、修正、解釋及宣導事項。三、關於職員任免、遷調、銓審及動態之擬辦事項。四、關於工作簡化之推行事項。五、關於職員待遇、福利、退休、資遣、撫卹及公務人員保險、全民健康保險之擬辦事項。六、關於職員考績、獎懲、差假及勤惰管理之擬辦事項。七、關於職員訓練、進修、人才儲備及人力規劃之擬辦事項。八、關於職員人事資料登記、保管、分析及運用事項。九、關於本署與所屬機關職員出入境案件之擬辦事項十、其他有關人事管理事項。