本辦法之評核程序如下：
一、受評核對象於接獲評核通知後，應擬具執行績效書面報告，於指定期間內送達中央主管機關。
二、依受評核對象提送之書面報告進行審查，並得擇定部分受評核對象或其所管轄之單位進行實地查核；完成書面審查及實地查核後，召開評核會議確定評核結果。