年度績效評鑑之程序如下：
一、自評：本中心應於會計年度終了前，擬具自評績效評鑑報告送董事會，經董事會通過後，於次年三月一日前報運動部。
二、複評：運動部收受前款自評績效評鑑報告後，應交評鑑會辦理複評，並於次年六月十五日前，作成績效評鑑報告。
三、核定：運動部應於次年六月三十日前，就前款績效評鑑報告予以核定，並於七月十五日前公告。
運動部應就前項第三款績效評鑑報告，作成分析報告，送立法院備查。
總體評鑑之程序，準用前二項規定。