本專戶之運用、分配、查核及監督，應設專戶管理會（以下簡稱管理會），置委員十一人，其中一人為召集人，由體育署署長兼任，一人為副召集人，由體育署副署長兼任；其餘委員，由教育部遴聘專家學者組成；任期二年，期滿得續聘（派）兼之。
管理會委員任一性別委員人數不得少於委員總數三分之一；委員出缺時，得補行遴聘，其聘期至原聘任委員任期屆滿之日止。