免稅商店有關之帳冊及編製之報表，應於年度盤存結案後，保存五年；其有關之憑證保存三年。
前項有關之憑證，免稅商店得於盤存結案後報經監管海關核准，以電子媒體按序儲存後，依規定年限保存，其原始單證得予銷毀。
但監管海關進行查案，須複印單證及有關文件時，免稅商店應負責提供，不得拒絕。