本基金董事會置董事九人至十五人，其中一人為董事長，均由行政院院長聘任。
董事人選，除國防部部長及經濟部部長為當然董事外，應就有關部會首長、國內外有關科學技術富有研究之專家、學者及社會人士遴聘之。
任期為三年，期滿得續聘。