本辦法依法官法（以下簡稱本法）第十一條第五項規定訂定之。
本辦法所稱院長，指高等法院以下各法院及高等行政法院、其他專業法院院長。
院長之任期為三年，自實際到職之日起算，得連任一次。
但司法院認為確有必要者，得再延任之，其期間以三年為限。
院長調任同審級或不同審級法院院長者，其任期應合併計算。
院長於本法施行後轉任司法行政人員者，其任期應合併計算；司法行政人員於本法施行後調任院長者，其於本法施行後擔任司法行政人員之任期，應與院長任期合併計算。
前項合併計算之任期，以六年為限。
但司法院認確有必要者，得延任之，延任任期不得逾三年。
第一項或前項任期，於免兼院長或回任法官本職逾二年時，重行起算。
院長曾任檢察長者，其任檢察長之任期，不予併計。
司法院每年應對院長之品德、操守、執行職務之能力及參與審判工作之努力等事項，綜合考評其服務成績，並徵詢該院法官意見。
司法院得視業務需要，並參酌前項服務成績與徵詢結果、各級法院團體績效評比結果及其他相關資料，予以調任、連任或延任。
前項院長之調任，除法令另有規定外，應於下列範圍內行之：一、調任其他法院或其分院院長、庭長。
二、調任司法院或其所屬機關相當之職務。
院長任期屆滿前，因事實需要，亦得調任之。
連任任期即將屆滿之院長有下列情形之一，且有延任之必要者，應由司法院敘明具體理由，提請司法院人事審議委員會審議是否再延任之：一、不同審級法院院長間之調任。
二、高等法院分院院長調任高等法院院長。
三、院長與司法行政人員間之轉任。
四、其他因應業務特殊需求。
司法院得視業務需要，並參酌前條第一項服務成績與徵詢結果、各級法院團體績效評比結果及其他相關資料，對任期尚未屆滿之院長，免兼其院長職務。
院長年滿七十歲者，應停止辦理審判案件，並免兼院長職務。