鐵路軍事運輸依本條例之規定；本條例未規定者，依其他有關法律之規定。
本條例所稱鐵路及軍事運輸機關如左：一、鐵路指鐵路法第二條所列之各鐵路。
二、軍事運輸機關指負責執行國軍鐵路運輸之軍事主管機關。
鐵路軍事運輸依照鐵路規定計算運費，其實際收費標準，由行政院核定之。
為應鐵路軍事運輸需要，必須增置專供鐵路軍事運輸使用之特種設備暨所需費用，由國防部、交通部會同擬訂計劃，呈請行政院核定辦理。
鐵路軍事運輸以國軍部隊官兵、軍事學校員生及其裝備以內之軍品為限。
前項軍品由交通部、國防部按其種類、性質及名稱會同擬訂鐵路軍事運輸軍品分類表，呈報行政院核定。
陣亡或因公死亡官兵之靈柩、骨灰或屍體，比照鐵路軍事運輸辦理。
鐵路軍事運輸得根據軍事需要及鐵路運輸能力，儘量予以優先；如因突發變故或進入警戒或戰爭狀態時，鐵路主管機關為適應調動部隊及其補給品之緊急軍事運輸，得暫停一部分客貨營業。
前項緊急軍事運輸，由各路區最高軍事運輸機關通知鐵路主管機關辦理之。
國軍部隊官兵、軍事學校員生及軍品之運輸，應由軍事運輸機關填發車照及運照。
車照及運照應載明之事項如左：一、車照：(一)部隊番號或代字。
(二)部隊種類及人數。
(三)需用車輛種類及輛數。
(四)起訖車站名稱。
(五)啟運日期及時間。
(六)其他必要事項。
二、運照：(一)託運單位及接收單位。
(二)軍品種類及數量。
(三)需用車輛種類及輛數。
(四)起訖車站名稱。
(五)啟運日期及時間。
(六)其他必要事項。
鐵路軍事運輸應由託運單位向軍事運輸機關申請，經軍事運輸機關填發車照或運照，持向鐵路主管機關託運。
非鐵路正常運輸能力所能負擔之大量軍事運輸，應由軍事運輸機關事前洽商鐵路主管機關編製運輸計劃。
鐵路軍事運輸專用列車之編組，由軍事運輸機關與鐵路主管機關商定之。
鐵路軍事運輸列車之配車原則如左：一、運送部隊應儘先撥配客車，如因緊急軍事運輸調集不及或不足時，得以適宜車輛代替之。
二、運送軍品，按其種類及性質，撥配適宜裝載之貨車。
鐵路軍事運輸專用列車，軍事運輸機關應指派隨車運輸指揮官。
保密及貴重軍品或依鐵路主管機關規定需派押運人者，應派人隨車押運。
鐵路軍事運輸之軍品不滿一車者，如非緊急狀況，不得使用一車。
但危險品之運輸，另依鐵路危險品運輸辦法辦理。
鐵路軍事運輸車輛到達目的站後，應於規定時間內騰空，不得拖延滯留。
鐵路軍事運輸軍品之裝卸，由軍方自理者，應於鐵路主管機關所訂貨物裝卸時限內，裝卸完畢。
不依照前二項規定者，應按鐵路主管機關規定，核收車輛滯留費。
鐵路軍事運輸經兩路以上者，適用鐵路聯運規章之規定。
軍事運輸機關或託運單位，非經鐵路主管機關同意，不得占用鐵路機車、車輛及辦公處所、電報、電話等設備。
鐵路從業人員或軍事運輸機關及託運單位人員，違反本條例之規定者，由各該主管機關分別議處。