本辦法依加工出口區設置管理條例第十一條之三第二項規定訂定之。
本辦法所稱建築物，指供生產、營運、服務及相關使用之建築物。
加工出口區管理處（以下簡稱管理處）或分處建築物之租售，應公告下列事項：一、標示、用途及使用限制。
二、容許引進之產業類別。
三、承租或承購資格。
四、承租或承購手續。
五、出租之租金或出售之售價。
六、其他應檢附之文件。
承租或承購建築物，應向所在區管理處或分處申請，並簽訂預約書，繳存預約金。
前項預約金應按預訂承租面積六個月租金或出售價金百分之五繳存。
申請人應於繳存預約金之次日起十四日內，提出投資申請案；逾期未提出者，預訂建築物不予保留，預約金無息退還。
第一項預約金於投資案核准時，得無息抵充應繳之租金、擔保金或價款；未經核准時，無息退還。
申請人應於投資案核准後，經所在區管理處或分處通知核配租購建築物之次日起六十日內，按核配面積簽訂租、購契約；逾期未完成簽約手續，該建築物不再保留，預約金不予退還。
前項所定期限，申請人如有正當理由，得申請管理處或分處核准酌予延長，延長次數不限，但延長之期限，合計不得逾一年。
申請人因故申請換租購同一加工出口區內建築物，如屬承租者，應於租賃契約簽訂前，以書面提出；如屬承購者，應於發給所有權移轉同意函前，以書面提出，均以一次為限。
前項換租購後租售價金增減部分，應補繳或退還預約金之差額。
承租人應於訂約之日起，依約繳交租金及擔保金。
前項擔保金，以二個月租金計算。
第一項租金應逐期依約定日期繳交；擔保金應於租約終止，且無應負擔保責任事由發生後三十日內，無息退還。
租賃契約，應辦理公證，所需費用由雙方平均負擔。
建築物之租金，依建築物成本、取得費用及資金成本計算，並應考量下列因素：一、稅捐、規費、保險費及土地租金。
二、建築物維修費用。
建築物分層出租者，第一樓層應依前項租金加計百分之十計收，頂樓應依前項租金減計百分之十收取。
管理處得依經營、管理、招商需要或其他特殊情勢，提出本辦法所定租金計收優惠調整方案，經陳報經濟部後實施。
建築物之租賃期間，為一年以上二十年以下。
承租人於租賃期間無違反租賃契約情事，得於租期屆滿前三個月，以書面提出續租之申請。
建築物出租供短期臨時使用者，租用期間最長為六個月，必要時得展延之；展延以二次為限，並不得超過一年。
建築物之出售，得依實際作業狀況，訂定分期繳納方式及期限；一次繳清者，申請人應依繳款通知書所載期限內繳清價款；分期繳交者，申請人依各該繳款期限分期繳交；逾繳款期限未繳交價款者，均視同放棄承購，除分期繳交之已繳價款無息退還外，原繳預約金不予退還。
申請人於繳清價款後，由所在區管理處或分處發給所有權移轉同意函，並配合辦理所有權移轉手續，所需費用，由申請人負擔。
建築物之售價，依建築物成本，加計取得費用及資金成本計算。
本辦法自發布日施行。
本辦法中華民國九十八年四月八日修正之條文，自中華民國九十八年一月一日施行。