本辦法所稱之廢品，係指加工出口區區內事業所有不堪使用之機器、設備、零組件，或因過期、變質、破損、災害，致無法出售、加工製造之商品、原料、物料、在製品、製成品、副產品、次品。
本辦法所稱之下腳，係指加工出口區區內事業在其製造過程中，所殘餘之渣滓、廢料，為該事業不能利用者。
區內事業銷毀廢品、下腳，應先向經濟部加工出口區管理處或分處（以下簡稱管理處或分處）申請核准；由管理處或分處依區內事業除帳需求會同駐區海關、稽徵機關監毀。
前項會辦機關之一，如無法在指定時間派員到場，管理處或分處得會同另一會辦機關人員辦理；報廢清冊無保稅貨品時，海關免會同監毀。
區內事業如需代客戶申請銷毀廢品、下腳，準用前條規定辦理。
區內事業依前二條規定辦理銷毀廢品、下腳後，管理處或分處應作成紀錄，記載下列事項，函送區內事業並副知相關單位：一、申請之區內事業名稱；代客銷毀者，並應列明客戶名稱。
二、監毀日期、地點。
三、監毀清單。
四、區內事業及監毀機關所派人員簽名。
區內事業之廢品、下腳經監毀後本身不能利用而能變價，欲輸往課稅區時，依下列規定辦理：一、保稅之廢品、下腳，免受簽審規定之限制，由區內事業逕向轄區海關辦理通關事宜。
二、非保稅之廢品、下腳，由區內事業開立貨品出區（廠）放行單出區。
區內事業不能變價、收入低微、不敷支出之廢品、下腳，經監毀後，得作廢棄物清理，並由區內事業開立貨品出區（廠）放行單或管制遞送三聯單出區。
但經管理處或分處、駐區海關及稽徵機關會同指定之項目，得免除監毀，作廢棄物清理。
區內事業廢品、下腳，除依本辦法規定處理外，其清理應依環保相關法令規定辦理。
區內事業廢品、下腳經監毀後，得核實沖銷保稅帳，並依稅法相關規定，由稽徵機關核實認定損失，自會計帳冊沖銷。
管理處或分處對於區內事業經核准清理之廢品、下腳，得令其限期清理。
經核准在區內設有營業或聯絡處所之事業所有在區內之廢品、下腳，準用本辦法規定辦理。