秘書室掌理事項如下：
一、印信典守及文書、檔案之管理。
二、議事、出納、採購及其他事務管理。
三、本中心辦公廳、首長宿舍等不動產取得、營繕及管理配置。
四、工友（含技工、駕駛）之管理。
五、本中心緊急突發事件應變之聯繫及安全防護。
六、不屬其他各組、室、園區事項。