為執行海洋庇護區保育計畫，得實施下列保育措施：
一、監測：對範圍標示、生態或物種之調查、資料分析或研究。
二、物種復育：繁殖或培育原生物種進行增裕、放流、種植或移植等。
三、棲地維護：清除妨礙物種繁殖生存之障礙物、投放有助物種繁殖生存之人工設施或清除外來種等。
四、物種保育：對特定物種限制採捕區域、採捕季節或限制採捕體型。
五、巡查：定期或不定期以人員或搭配無人機等科技工具巡視。
六、教育宣導：加強海洋環境保育教育或宣導，鼓勵民眾參與保育或復育行動。
七、其他經中央主管機關公告之保育措施。