本院之業務範圍如下：
一、中醫醫療業務之執行、推廣及臨床研究。
二、中醫診療儀器及軟體之研發。
三、中醫基礎醫學之研究。
四、中藥製程、製劑、藥理、檢驗之研究。
五、藥用植物種植研究及教育之推廣。
六、中醫藥典籍、文物之典藏、研究及教育推廣。
七、國內外中醫藥科技研究合作及科技專業人才培訓。
八、中醫藥研發產品銷售、技術移轉及技術服務。
九、其他與中醫相關之事項。
本院依前項任務之需要，得附設相關機構及場館。