海洋資源處掌理事項如下：
一、海洋資源永續發展之統合規劃、協調及推動。
二、海域空間使用之規劃、統合、協調及有關機制之推動。
三、海洋產業發展之統合規劃、協調及推動。
四、其他有關海洋資源之統合及協調事項。