本會之次級機關及其業務如下：
一、海巡署：規劃與執行海域及海岸巡防事項。
二、海洋保育署：規劃與執行海洋保育事項。
海洋委員會組織法 第5條
第5條
其他條文
全文- 第1條行政院為統合海洋相關政策規劃、協調及推動，並辦理海域與海岸巡防及海洋保育、研究業務，特設海洋委員會（以下簡稱本會）。
- 第2條本會掌理下列事項：一、海洋總體政策與基本法令之統合規劃、審議、協調及推動。二、海洋產業發展之統合規劃、協調及推動。三、海…
- 第3條本會置主任委員一人，特任；副主任委員三人，其中二人職務比照簡任第十四職等；另一人職務列簡任第十四職等。本會置委員十七人至…
- 第4條本會置主任秘書，職務列簡任第十二職等。
- 第6條本會為應業務需要，得報請行政院核准，派員駐境外辦事，並依駐外機構組織通則規定辦理。
- 第7條本會各職稱之官等職等及員額，另以編制表定之。前項編制表列有官等職等之人員，得在不逾編制員額二分之一範圍內，就官階相當之警…
- 第8條本會成立時，由其他機關移撥人員之任用、管理及權利義務，依各該人員身分適用之相關法令辦理。
- 第9條本法施行日期，由行政院以命令定之。
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