本局設下列組、室：
一、證券發行組，分五科辦事。
二、證券商管理組，分五科辦事。
三、證券交易組，分四科辦事。
四、投信投顧組，分四科辦事。
五、會計審計組，分四科辦事。
六、期貨管理組，分六科辦事。
七、秘書室。
八、人事室。
九、政風室。
十、主計室。
十一、資訊室。