本法第三十九條所定中央目的事業主管機關，應依事業廢棄物產生源所屬業別或屬性認定之；所定再利用用途目的事業主管機關，應依事業廢棄物再利用機構所屬業別或屬性認定之。
前項目的事業主管機關之認定產生爭議時，由中央主管機關報請行政院指定之。