藥師公會每年開會員（會員代表）大會一次，必要時得召開臨時大會。
藥師公會會員人數超過三百人以上時，得依章程之規定就會員分布狀況劃定區域，按其會員人數比例選定代表，召開會員代表大會，行使會員大會之職權。