新埔工作站掌理下列事項：
一、果樹與特用作物品種改良、栽培技術試驗研究、良種繁殖及示範推廣。
二、果樹與特用作物產銷輔導、教育訓練及技術諮詢。
三、果樹與特用作物遺傳資源蒐集、保存及利用。