企劃處分設企研科、開發科、地權科、綜核科四科分別掌理下列事項：一、企研科（一）鐵路建設營運中長程發展計畫。
（二）政府年度經建（鐵路）計畫先期作業之彙編。
（三）鐵路資源規劃，有關事業計畫編擬及資本支出預算彙編。
（四）鐵路資源規劃，有關重大改革業務彙辦。
（五）鐵路重大建設計畫之綜合研析。
（六）配合政府其他重大建設計畫之綜合研析。
（七）都會區鐵路立體化改善之綜合研析。
（八）都會區鐵路轉型捷運化之綜合研析。
（九）鐵路事業策略綜合研析。
（十）鐵路事業專案計畫之綜合研析。
（十一）其他交辦事項。
二、開發科（一）不動產運用策略及附屬事業發展計畫。
（二）不動產開發利用計畫之綜合研析。
（三）不動產開發系統建立及資料建檔與更新。
（四）土地開發有關之都市計畫、市地重劃等相關業務之綜合研析。
（五）都市更新之規劃及執行業務。
（六）促進民間參與公共建設之規劃及執行業務。
（七）車站特定專用區規劃及建設業務。
（八）其他土地開發、招商興建及營運等相關業務。
（九）公共設施多目標使用申請及執行業務。
（十）其他交辦事項。
三、地權科（一）不動產管理系統建立及資料建檔與更新。
（二）鐵路建設或營運需用土地之徵收、價購、撥用等相關業務。
（三）不動產現場管理及維護業務。
（四）不動產被占用之排除及相關處理措施。
（五）不動產出租及提供使用等相關業務。
（六）不動產出售及其他處分等相關業務。
（七）不動產提供地方政府綠美化等相關業務。
（八）配合辦理地權有關之都市計畫通盤檢討與變更等相關業務。
（九）不動產財產增加、減損及所有權變更登記等相關事項。
（十）其他交辦事項。
四、綜核科（一）宿舍及附屬事業建築物之物業管理系統建立及資料建檔與更新。
（二）宿舍使用、管理、修繕等相關事宜之統籌業務。
（三）附屬事業不動產之物業管理。
（四）企劃處、資訊中心人力規劃、訂定、執行、督導、考核。
（五）企劃處、資訊中心年度預算編列、執行、控管。
（六）企劃處文書處理、檔案管理。
（七）企劃處庶務管理及帳務管理。
（八）企劃處常年、一般及專業教育訓練。
（九）其他交辦事項。
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