本辦法所稱管理機關，在中央為經濟部水利署，並由各該海堤所在水利署所屬河川分署執行各項管理事項；在直轄市為直轄市政府；在縣（市）為縣（市）政府，或由其設置機關管理之。
事業性海堤之整建、維護、防汛搶險、養護及其他有關事宜，由各該目的事業主管機關或事業機構辦理。