少年輔育院設院務委員會，由院長、秘書、組長及各主管人員組織之，以院長為主席。
關於學生之管理，感化教育之免除或停止執行之聲請及其他院內行政之重要事項，應經院務委員會之決議。
但有急速處分之必要時，得先由院長行之，提報院務委員會。