本法第九條第三項規定中央政府各機關應專戶存管之款項，指左列各種款項：
一、依法律、條約、協定，設定基金之命令、契約、或遺囑所定應專戶存管之特種基金。
二、各機關歲入以外依法令所定應專戶存管之其他公款暨保管款項。
三、暫緩實施集中支付機關之經費款項。
前項各款專戶存管款項之收支管理，應依行政院核定之中央政府各機關專戶存管款項收支管理辦法辦理。