第5條業務一組掌理事項如下：一、一般進口、出口、轉運貨物之通關。二、進口稅則預先審核及疑義案件之處理。三、進口貨物補稅、免稅、押款、退款、先放後稅、按月彙繳、分期繳納關稅及暫准通關案件之處理。四、進出口報單審核、副本核發及貨物稅完（免）稅照之處理。五、進口貨物艙單之處理及報單、貨樣之管理。六、逾期不報關、不繳稅、不退運及聲明放棄貨物之處理。七、違章及行政救濟案件之處理。八、推廣貿易服務費代徵作業。九、其他有關進口、出口貨物通關事項。