本辦法依財團法人法（以下簡稱本法）第九條、第二十四條第三項及第二十五條第五項規定訂定之。
本辦法所稱科技事務財團法人（以下簡稱財團法人），指以促進科學技術發展為目的，從事科學技術研究發展及相關科技推廣或服務為主要業務之財團法人。
財團法人之設立許可及監督，應依本法及本辦法之相關規定辦理。
財團法人申請設立時，其捐助財產須足以達成設立目的及業務宗旨，其設立基金之財產總額不得少於新臺幣三千萬元。
前項捐助財產，現金須達新臺幣一千萬元以上，其餘得以動產、不動產或有價證券代之。
財團法人在法院登記之財產總額達新臺幣一億元以上者，應建立內部控制及稽核制度，報本部備查；其財務報表應經會計師查核簽證，並應依下列原則，訂定誠信經營規範，經董事會通過後實施，修正時亦同：一、財團法人之董事、監察人、執行長、受僱人、受任人或具有實質控制能力者，於從事業務行為之過程中，不得直接或間接提供、承諾、要求或收受任何不正當利益，或做出其他違反誠信、不法或違背受託義務等不誠信行為，以求獲得或維持利益。
二、財團法人為健全誠信經營之管理，應設置或指定專責單位，負責誠信經營政策與防範不誠信行為方案之制定及監督執行，並定期向董事會報告。
三、財團法人應提供檢舉管道，並對於檢舉人身分及檢舉內容確實保密。
四、財團法人應明定違反誠信經營規範之懲戒與申訴制度。
前條之財團法人，依本法第二十五條第一項規定應送本部備查之工作計畫、經費預算、工作報告及財務報表，其格式、項目、編製方式、應記載事項及其他應遵行事項，依本部規定（附件一及附件二）辦理。