行政院環境保護署毒物及化學物質局（以下簡稱本局）為處理內部單位之分工職掌，特訂定本規程。
局長綜理局務，並指揮、監督所屬人員；副局長襄助局長處理局務。
主任秘書權責如下：一、文稿之綜核及代判。
二、機密及重要文件之處理。
三、各單位之協調及權責問題之核議。
四、重要會議之籌辦。
五、其他交辦事項。
本局設下列組、室：一、綜合規劃組，分四科辦事。
二、評估管理組，分四科辦事。
三、危害控制組，分三科辦事。
四、秘書室。
五、人事室。
六、政風室。
七、主計室。
綜合規劃組掌理事項如下：一、毒物與化學物質管理政策、法規之研擬及協調。
二、毒物與化學物質國際合作、科技發展之策劃、推動、協調及執行。
三、毒物與化學物質綜合研究之策劃、推動、協調及執行。
四、毒物與化學物質相關國家標準之跨部會協調。
五、毒物與化學物質資訊系統之規劃、建置、資訊整合及運用分析。
六、毒物與化學物質邊境管理之規劃、協調及執行。
七、其他有關毒物及化學物質綜合規劃事項。
評估管理組掌理事項如下：一、毒物與化學物質管理政策、法規之執行及督導。
二、毒性化學物質管理、評估、公告列管之研擬、執行及督導。
三、環境用藥管理政策與法規之研擬、執行及督導。
四、毒物與化學物質危害評估管理方法之研究、發展執行及督導。
五、其他有關毒物及化學物質管理評估事項。
危害控制組掌理事項如下：一、毒物與化學物質災害防制政策、法規之研擬、執行及督導。
二、毒物與化學物質災害預防、整備之規劃、協調、執行及督導。
三、毒物與化學物質災害監控、通報之協調、執行及督導。
四、毒物與化學物質災害技術之蒐集、研究、分析規劃及協調執行。
五、毒物與化學物質勾稽、查核之規劃、協調及執行。
六、毒物與化學物質數量、流向管理之規劃、協調及執行。
七、其他有關毒物與化學物質危害控制、勾稽及查核事項。
秘書室掌理事項如下：一、印信典守及文書、檔案之管理。
二、出納、財務、營繕、採購及其他事務管理。
三、國會聯絡與媒體公關事務之政策規劃、分析、執行及管考。
四、工友（含技工、駕駛）之管理。
五、不屬其他各組、室事項。
本局處理業務，實施分層負責制度，依分層負責明細表逐級授權決定。