本準則依兒童及少年性剝削防制條例（以下簡稱本條例）第二十二條第二項規定訂定之。
中途學校行政組織之設置如下：一、教務處：設教學、資訊、設備等組。
二、學生事務處：設訓育、生活教育、衛生、住宿等組。
三、總務處：設文書、事務、出納等組。
四、輔導處（室）：設輔導、特教等組。
前項處（室）或組之設置，得由各中途學校視實際需要，整合其功能並調整其名稱；其最高設置基準如下：一、五班以下或經直轄市、縣（市）主管機關核定安置人數（以下簡稱核定安置人數）未達五十人：設三處（室）及七組。
二、六班以上或核定安置人數五十人以上：設四處（室）及九組。
前二項各行政組織之設置及掌理事項，由直轄市、縣（市）主管機關定之。
中途學校員額編制如下：一、校長：每校置校長一人。
二、主任、組長：各處（室）置主任一人，由專任教師兼任；各組置組長一人。
三、教師：國小部，每班置教師二人；國中部或高級中等學校部，每班置教師三人。
四、導師：每班置導師一人，由專任教師兼任之。
五、專任輔導教師：依核定安置人數，每二十五人置一人，未滿二十五人者，以二十五人計。
六、教師助理員：依核定安置人數，每二十人置一人，未滿二十人者，以二十人計。
七、住宿生管理員（住宿生輔導員）：每校置五人，核定安置人數超過四十人者，每增加十人，增置一人；無住宿生管理員者，置住宿生輔導員。
八、營養師、護理師或護士：應依學校衛生法規定設置；以分校設置者，應於分校置護理師或護士一人。
九、幹事、助理員、管理員、書記：按同等級學校一般標準配置。
十、醫師：得置兼任醫師一人。
十一、專業人員（社會工作師、社會工作員、臨床心理師、諮商心理師或職業輔導專業人員）：每校依需要置四人至六人。
十二、技士、技佐：設有技術型高級中等學校部者，置技士或技佐一人。
十三、工友、技工、駕駛：視實際需要配置。
前項第二款各組組長，其專、兼任之規定如下：一、總務處之組長：由職員專任。
二、負責生活輔導業務之組長：由具輔導知能之專任教師或人員兼任。
三、負責安置學生出入校之組長：由專業人員兼任。
四、前三款以外之組長：由專任教師兼任。
中途學校設人事室或置人事管理員，依人事機構人員設置有關規定辦理；設主（會）計室或置主（會）計員，依主計機構人員設置有關規定辦理。
中途學校軍訓教官之員額編制，依軍訓教官員額設置之相關規定辦理。
本準則所列各職稱之官等職等、級別及員額，由中途學校擬訂員額編制表報直轄市、縣（市）主管機關核定，並由直轄市、縣（市）主管機關轉請考試院核備。
各職稱之官等職等，依職務列等表之規定。